Mångfalden för institutioner för högre utbildning i Förenade Arabemiraten väcker oro bland myndigheter beträffande utbildningsstandarder, eftersom olika universitet använder olika tillvägagångssätt och bedömningskriterier som kan påverka utbildningens kvalitet i allmänhet.
I synnerhet väcker utbildningsinstitutionerna i Dubai och Ras Al Khaimah, som ligger i fria ekonomiska zoner, oro. Många av de utländska universiteten öppnar sina filialer utan licens från ministeriet för högre utbildning och vetenskaplig forskning. Sådana filialer, till skillnad från federala universitet, vars standarder fastställs av ministeriet, styrs av de utländska universitetens standarder, vilket leder till att det inte finns några enhetliga resultat.
I Dubai Free Economic Zone Dubai Knowledge Village (Dubai Knowledge Village) finns det cirka 20 universitet som kontrolleras av kunskaps- och mänskliga utvecklingsmyndigheten (KHDA). Det finns 14 universitet i Ras Al Khaimah Free Trade Zone.
I huvudstaden i Förenade Arabemiraten är Abu Dhabi mycket svårare att öppna ett privat universitet eller en filial av en utländsk utbildningsinstitution. Abu Dhabis utbildningsstandarder är harmoniserade mellan Abu Dhabi Education Board (Adec) och utbildningsministeriet. Eftersom det inte finns några specialiserade utbildningsorienterade fria ekonomiska zoner i huvudstaden, måste alla universitet vara licensierade av ministeriet för högre utbildning och ackrediterade av kommissionen för akademisk ackreditering (CAA), som granskar programmens och akademiska personal vid universitetets beslut.
Många företrädare för stora universitet i Förenade Arabemiraten anser att alla institutioner för högre utbildning helst bör ha licens av ministeriet för utbildningsverksamhet och ackrediteras av de berörda myndigheterna. Endast i detta fall kan man vara säker på att säkerställa en anständig kvalitet på högre utbildning i Emiraten.
